全自動離子色譜儀是常用的檢測設備之一，是高效液相色譜的一種，其有別于傳統離子交換色譜柱色譜的主要是樹脂具有很高的交聯度和較低的交換容量，進樣體積很小，用柱塞泵輸送淋洗液通常對淋出液進行在線自動連續電導檢測。
分離的原理是基于離子交換樹脂上可離解的離子與流動相中具有相同電荷的溶質離子之間進行的可逆交換和分析物溶質對交換劑親和力的差別而被分離。
全自動離子色譜儀的工作過程是：將流動相以穩定的流速(或壓力)輸送至分析體系，在色譜柱之前通過進樣器將樣品導入，流動相將樣品帶入色譜柱，在色譜柱中各組分被分離，并依次隨流動相流至檢測器，抑制型離子色譜則在電導檢測器之前增加一個抑制系統，即用另一個高壓將再生液輸送到抑制器，在抑制器中，流動相的背景電導被降低，然后將流出物導入電導檢測池，檢測到的信號送至數據系統記錄、處理或保存。
全自動離子色譜儀的維護
1、對泵的維護：
(1)每次儀器使用前，通水20min，用于清洗泵和整個流路。
(2)每次實驗完畢，通水20min，將泵中殘留的流動相清洗干凈。(注意：此步非常重要，直接關系到泵的正常使用)
(3)儀器長時間不用，一周得通去離子水一次。用于替換泵中已經滋生了少量微生物的去離子水。去離子水如果長期放置，會促使少量微生物的繁殖，微生物容易粘附在泵內的單向閥上。
2、對色譜柱的維護：
(1)進入色譜柱的樣品，均需要對其進行前處理。樣品中固體懸浮物、有機物和重金屬是影響色譜柱柱效的三大因素。
固體懸浮物的消除：使用0.45或0.22微米孔徑的微孔濾膜將樣品過濾即可。
有機物：固態樣品，其各檢測組份對高溫仍比較穩定的，可以采用高溫灰化-淋洗液或去離子水浸取法將有機，直接IC檢測。
液態樣品，可以采用22%雙氧水微波消解1.5h除去有機物后調節PH至中性，直接IC進樣檢測。(注意溶液濃度之間的換算)
重金屬：可以將樣品流經陽離子交換樹脂除去重金屬后直接IC進樣。
(2)組份高含量樣品影響色譜柱柱效。
高Cl-樣品的處理：將樣品通過Ag處理柱將Cl-除去后進樣或稀釋后進樣分析。
高SO42-樣品的處理：將樣品通過Ba處理柱將SO42-除去后進樣或稀釋后進樣分析。
(3)實驗操作完畢，色譜柱用淋洗液密封保存。
3、對抑制器的維護：
通陰離子淋洗液時將電流旋鈕打開，陰離子檢測完成關閉泵以前將電流旋鈕關閉。
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